Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3P09920 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf3P09920 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms