Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc9P09633 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hoxc9P09633 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc9P09633 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms