Protein–RNA interactions for Protein: P09542

Myl3, Myosin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl3P09542 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myl3P09542 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl3P09542 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl3P09542 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl3P09542 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl3P09542 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl3P09542 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl3P09542 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myl3P09542 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myl3P09542 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Myl3P09542 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myl3P09542 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myl3P09542 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myl3P09542 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myl3P09542 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Myl3P09542 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myl3P09542 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms