Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NefmP08553 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NefmP08553 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NefmP08553 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NefmP08553 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NefmP08553 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NefmP08553 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NefmP08553 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NefmP08553 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NefmP08553 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NefmP08553 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NefmP08553 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NefmP08553 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NefmP08553 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NefmP08553 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NefmP08553 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NefmP08553 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NefmP08553 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NefmP08553 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NefmP08553 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NefmP08553 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NefmP08553 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NefmP08553 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NefmP08553 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NefmP08553 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NefmP08553 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NefmP08553 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NefmP08553 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NefmP08553 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NefmP08553 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NefmP08553 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NefmP08553 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NefmP08553 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NefmP08553 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NefmP08553 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NefmP08553 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NefmP08553 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NefmP08553 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NefmP08553 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NefmP08553 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NefmP08553 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NefmP08553 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NefmP08553 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NefmP08553 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NefmP08553 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NefmP08553 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NefmP08553 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NefmP08553 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NefmP08553 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NefmP08553 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NefmP08553 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NefmP08553 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NefmP08553 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NefmP08553 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NefmP08553 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NefmP08553 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NefmP08553 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NefmP08553 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NefmP08553 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NefmP08553 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NefmP08553 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NefmP08553 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NefmP08553 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NefmP08553 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NefmP08553 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NefmP08553 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NefmP08553 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NefmP08553 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NefmP08553 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NefmP08553 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NefmP08553 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NefmP08553 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NefmP08553 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NefmP08553 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NefmP08553 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NefmP08553 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NefmP08553 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NefmP08553 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NefmP08553 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NefmP08553 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NefmP08553 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NefmP08553 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NefmP08553 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NefmP08553 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NefmP08553 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NefmP08553 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NefmP08553 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NefmP08553 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NefmP08553 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NefmP08553 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NefmP08553 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NefmP08553 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NefmP08553 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NefmP08553 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NefmP08553 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NefmP08553 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NefmP08553 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NefmP08553 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NefmP08553 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NefmP08553 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms