Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Prm2P07978 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Prm2P07978 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms