Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrlP06879 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrlP06879 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrlP06879 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrlP06879 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrlP06879 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrlP06879 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrlP06879 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrlP06879 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrlP06879 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PrlP06879 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrlP06879 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrlP06879 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrlP06879 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrlP06879 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrlP06879 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrlP06879 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrlP06879 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrlP06879 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrlP06879 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrlP06879 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrlP06879 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrlP06879 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrlP06879 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrlP06879 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrlP06879 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrlP06879 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrlP06879 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrlP06879 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrlP06879 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrlP06879 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrlP06879 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrlP06879 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrlP06879 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrlP06879 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrlP06879 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrlP06879 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrlP06879 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PrlP06879 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PrlP06879 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrlP06879 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrlP06879 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrlP06879 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrlP06879 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrlP06879 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrlP06879 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrlP06879 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrlP06879 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrlP06879 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrlP06879 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PrlP06879 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrlP06879 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrlP06879 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrlP06879 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrlP06879 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrlP06879 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrlP06879 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrlP06879 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrlP06879 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms