Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TnfP06804 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TnfP06804 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TnfP06804 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TnfP06804 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TnfP06804 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TnfP06804 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TnfP06804 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TnfP06804 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TnfP06804 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TnfP06804 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TnfP06804 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TnfP06804 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TnfP06804 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TnfP06804 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TnfP06804 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TnfP06804 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TnfP06804 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TnfP06804 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TnfP06804 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TnfP06804 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TnfP06804 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnfP06804 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnfP06804 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnfP06804 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnfP06804 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnfP06804 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnfP06804 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnfP06804 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnfP06804 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnfP06804 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnfP06804 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TnfP06804 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TnfP06804 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TnfP06804 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TnfP06804 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TnfP06804 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TnfP06804 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TnfP06804 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TnfP06804 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TnfP06804 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TnfP06804 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TnfP06804 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TnfP06804 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TnfP06804 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TnfP06804 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TnfP06804 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TnfP06804 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TnfP06804 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TnfP06804 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TnfP06804 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TnfP06804 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TnfP06804 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TnfP06804 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TnfP06804 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TnfP06804 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TnfP06804 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TnfP06804 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TnfP06804 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TnfP06804 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TnfP06804 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TnfP06804 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TnfP06804 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TnfP06804 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TnfP06804 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TnfP06804 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TnfP06804 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TnfP06804 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TnfP06804 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TnfP06804 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TnfP06804 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TnfP06804 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TnfP06804 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TnfP06804 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TnfP06804 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TnfP06804 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TnfP06804 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TnfP06804 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TnfP06804 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TnfP06804 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TnfP06804 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TnfP06804 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TnfP06804 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TnfP06804 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TnfP06804 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TnfP06804 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TnfP06804 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TnfP06804 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TnfP06804 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TnfP06804 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TnfP06804 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TnfP06804 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TnfP06804 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TnfP06804 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TnfP06804 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TnfP06804 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TnfP06804 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TnfP06804 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TnfP06804 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TnfP06804 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms