Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me1P06801 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me1P06801 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Me1P06801 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me1P06801 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me1P06801 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me1P06801 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me1P06801 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me1P06801 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Me1P06801 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me1P06801 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me1P06801 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me1P06801 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me1P06801 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me1P06801 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me1P06801 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me1P06801 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me1P06801 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me1P06801 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me1P06801 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Me1P06801 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Me1P06801 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me1P06801 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me1P06801 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me1P06801 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me1P06801 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me1P06801 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me1P06801 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me1P06801 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me1P06801 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me1P06801 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Me1P06801 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me1P06801 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me1P06801 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me1P06801 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me1P06801 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me1P06801 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Me1P06801 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me1P06801 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me1P06801 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me1P06801 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Me1P06801 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Me1P06801 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Me1P06801 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Me1P06801 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Me1P06801 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Me1P06801 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms