Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06335 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06335 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06335 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06335 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06335 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06335 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06335 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06335 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06335 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06335 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06335 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P06335 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06335 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06335 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06335 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06335 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06335 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06335 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06335 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06335 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06335 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06335 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06335 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06335 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06335 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06335 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06335 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06335 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06335 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06335 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06335 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06335 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06335 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06335 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06335 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P06335 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06335 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06335 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06335 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06335 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06335 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06335 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06335 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06335 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms