Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04212 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04212 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04212 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04212 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04212 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04212 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04212 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04212 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04212 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04212 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P04212 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04212 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04212 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04212 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04212 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04212 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04212 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04212 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04212 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04212 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04212 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04212 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04212 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04212 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04212 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04212 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04212 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04212 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04212 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04212 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04212 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04212 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04212 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04212 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04212 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04212 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04212 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04212 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04212 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04212 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04212 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04212 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P04212 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04212 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04212 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04212 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04212 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04212 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P04212 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04212 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04212 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04212 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P04212 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms