Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01853 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01853 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01853 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01853 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01853 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01853 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01853 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01853 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01853 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01853 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01853 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01853 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01853 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01853 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01853 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01853 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01853 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01853 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01853 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01853 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01853 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01853 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01853 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01853 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01853 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01853 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01853 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01853 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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