Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01788 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01788 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01788 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01788 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01788 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01788 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01788 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01788 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01788 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01788 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01788 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01788 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01788 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01788 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01788 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01788 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01788 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01788 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01788 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01788 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01788 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01788 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01788 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01788 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01788 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01788 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01788 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01788 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01788 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01788 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01788 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01788 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01788 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01788 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms