Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01727 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01727 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01727 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01727 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01727 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01727 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01727 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01727 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01727 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01727 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01727 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01727 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01727 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01727 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01727 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01727 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01727 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01727 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01727 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01727 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01727 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01727 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01727 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01727 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01727 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms