Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01659 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01659 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01659 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01659 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01659 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01659 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01659 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01659 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01659 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01659 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01659 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01659 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01659 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01659 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01659 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01659 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01659 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01659 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01659 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01659 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01659 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01659 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01659 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01659 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01659 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01659 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01659 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01659 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01659 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01659 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01659 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01659 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01659 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01659 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms