Protein–RNA interactions for Protein: P00687

Amy1, Alpha-amylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amy1P00687 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Amy1P00687 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amy1P00687 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amy1P00687 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amy1P00687 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amy1P00687 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amy1P00687 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amy1P00687 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Amy1P00687 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Amy1P00687 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Amy1P00687 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms