Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abl1P00520 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Abl1P00520 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abl1P00520 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abl1P00520 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abl1P00520 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abl1P00520 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abl1P00520 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abl1P00520 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abl1P00520 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abl1P00520 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abl1P00520 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abl1P00520 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Abl1P00520 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abl1P00520 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abl1P00520 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abl1P00520 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abl1P00520 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abl1P00520 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abl1P00520 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abl1P00520 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms