Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MscO88940 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MscO88940 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MscO88940 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MscO88940 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MscO88940 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MscO88940 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MscO88940 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MscO88940 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MscO88940 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MscO88940 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MscO88940 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MscO88940 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MscO88940 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MscO88940 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MscO88940 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MscO88940 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MscO88940 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MscO88940 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MscO88940 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MscO88940 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MscO88940 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MscO88940 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MscO88940 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MscO88940 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MscO88940 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MscO88940 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MscO88940 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MscO88940 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MscO88940 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MscO88940 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MscO88940 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MscO88940 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MscO88940 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MscO88940 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MscO88940 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MscO88940 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MscO88940 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MscO88940 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MscO88940 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MscO88940 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MscO88940 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MscO88940 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MscO88940 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MscO88940 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MscO88940 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MscO88940 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MscO88940 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MscO88940 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MscO88940 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MscO88940 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MscO88940 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MscO88940 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MscO88940 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MscO88940 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MscO88940 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MscO88940 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MscO88940 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MscO88940 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MscO88940 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MscO88940 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MscO88940 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MscO88940 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MscO88940 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MscO88940 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MscO88940 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MscO88940 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MscO88940 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms