Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hcn2O88703 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hcn2O88703 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms