Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cacng2O88602 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng2O88602 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms