Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sap30O88574 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sap30O88574 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sap30O88574 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sap30O88574 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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