Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AurkcO88445 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AurkcO88445 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AurkcO88445 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AurkcO88445 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AurkcO88445 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AurkcO88445 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AurkcO88445 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AurkcO88445 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AurkcO88445 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AurkcO88445 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AurkcO88445 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AurkcO88445 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AurkcO88445 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AurkcO88445 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AurkcO88445 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AurkcO88445 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms