Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme6O88425 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme6O88425 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme6O88425 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme6O88425 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme6O88425 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms