Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfdp1O88271 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms