Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm10509O88255 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10509O88255 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm10509O88255 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm10509O88255 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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