Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec11aO88200 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms