Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly86O88188 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly86O88188 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly86O88188 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly86O88188 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly86O88188 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly86O88188 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly86O88188 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly86O88188 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly86O88188 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly86O88188 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly86O88188 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly86O88188 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly86O88188 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly86O88188 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly86O88188 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly86O88188 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly86O88188 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly86O88188 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms