Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb5O70309 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms