Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmx1O70218 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmx1O70218 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms