Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd70O55237 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd70O55237 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd70O55237 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd70O55237 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd70O55237 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd70O55237 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd70O55237 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd70O55237 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd70O55237 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd70O55237 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd70O55237 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cd70O55237 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cd70O55237 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms