Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlx3O55144 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms