Protein–RNA interactions for Protein: O55131

Sept7, Septin-7, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept7O55131 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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Sept7O55131 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sept7O55131 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sept7O55131 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sept7O55131 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sept7O55131 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Sept7O55131 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sept7O55131 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sept7O55131 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sept7O55131 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sept7O55131 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sept7O55131 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sept7O55131 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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Sept7O55131 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Sept7O55131 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sept7O55131 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Sept7O55131 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Sept7O55131 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Sept7O55131 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Sept7O55131 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Sept7O55131 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Sept7O55131 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Sept7O55131 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Sept7O55131 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Sept7O55131 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sept7O55131 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept7O55131 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept7O55131 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept7O55131 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept7O55131 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept7O55131 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept7O55131 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sept7O55131 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms