Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap18O55128 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sap18O55128 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sap18O55128 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sap18O55128 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sap18O55128 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sap18O55128 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms