Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp10O55123 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms