Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syngr1O55100 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms