Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Copb2O55029 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb2O55029 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb2O55029 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb2O55029 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb2O55029 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Copb2O55029 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb2O55029 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Copb2O55029 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Copb2O55029 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb2O55029 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb2O55029 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb2O55029 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Copb2O55029 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms