Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SlkO54988 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SlkO54988 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SlkO54988 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SlkO54988 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SlkO54988 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SlkO54988 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SlkO54988 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SlkO54988 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SlkO54988 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SlkO54988 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SlkO54988 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SlkO54988 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SlkO54988 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SlkO54988 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SlkO54988 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SlkO54988 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SlkO54988 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SlkO54988 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SlkO54988 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SlkO54988 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SlkO54988 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SlkO54988 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SlkO54988 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SlkO54988 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SlkO54988 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SlkO54988 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SlkO54988 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SlkO54988 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SlkO54988 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SlkO54988 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SlkO54988 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SlkO54988 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SlkO54988 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SlkO54988 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SlkO54988 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SlkO54988 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SlkO54988 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SlkO54988 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SlkO54988 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SlkO54988 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SlkO54988 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SlkO54988 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SlkO54988 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SlkO54988 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SlkO54988 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SlkO54988 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SlkO54988 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SlkO54988 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SlkO54988 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SlkO54988 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SlkO54988 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SlkO54988 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SlkO54988 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SlkO54988 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SlkO54988 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SlkO54988 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SlkO54988 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SlkO54988 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SlkO54988 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SlkO54988 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SlkO54988 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SlkO54988 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SlkO54988 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SlkO54988 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SlkO54988 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SlkO54988 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SlkO54988 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SlkO54988 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SlkO54988 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SlkO54988 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SlkO54988 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SlkO54988 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SlkO54988 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SlkO54988 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SlkO54988 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SlkO54988 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SlkO54988 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SlkO54988 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SlkO54988 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SlkO54988 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SlkO54988 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SlkO54988 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SlkO54988 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SlkO54988 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SlkO54988 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SlkO54988 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SlkO54988 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SlkO54988 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SlkO54988 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SlkO54988 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SlkO54988 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SlkO54988 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SlkO54988 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.9 ms