Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema6bO54951 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms