Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarce1O54941 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms