Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rdh16O54909 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rdh16O54909 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rdh16O54909 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16O54909 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rdh16O54909 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rdh16O54909 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rdh16O54909 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh16O54909 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms