Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdk5r2O35926 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5r2O35926 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms