Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sp100O35892 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sp100O35892 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Sp100O35892 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sp100O35892 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sp100O35892 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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