Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch2O35516 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch2O35516 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Notch2O35516 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Notch2O35516 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Notch2O35516 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms