Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccrl2O35457 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccrl2O35457 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccrl2O35457 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccrl2O35457 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccrl2O35457 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccrl2O35457 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccrl2O35457 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccrl2O35457 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccrl2O35457 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccrl2O35457 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccrl2O35457 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccrl2O35457 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms