Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
E2f3O35261 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2f3O35261 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2f3O35261 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2f3O35261 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f3O35261 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2f3O35261 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
E2f3O35261 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f3O35261 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2f3O35261 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2f3O35261 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms