Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scarb2O35114 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Scarb2O35114 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Scarb2O35114 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarb2O35114 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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