Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap23O09044 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap23O09044 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap23O09044 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap23O09044 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap23O09044 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Snap23O09044 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snap23O09044 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snap23O09044 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snap23O09044 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snap23O09044 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snap23O09044 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms