Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkcshO08795 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcshO08795 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms