Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp12O08736 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp12O08736 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp12O08736 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp12O08736 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp12O08736 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp12O08736 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp12O08736 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp12O08736 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp12O08736 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp12O08736 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp12O08736 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp12O08736 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp12O08736 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp12O08736 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp12O08736 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp12O08736 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms