Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MsmbO08540 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MsmbO08540 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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