Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp955bL7N232 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp955bL7N232 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms